ГУП «Моҳии Тоҷикистон»  с 70-х по 1981 –е годы прошлого века функционировала как управление рыбоводством (управление рыбного хозяйства).  Впоследствии постановлением Госагропрома Республики Таджикистан за №623 от 03.10.1988-до апреля 1992 года действовал как производственное объединение «Рыбоводитель» при Правительстве Республики Таджикистан (Производственное объединение «Таджикрыба» при Правительстве Р Т). Постановлением Кабинета Министров Республики Таджикистан 10.04. 1992, №001-1062 до 2007 года зарегистрирован как Республиканское производственное объединение «Рыбоводитель» (РПО) «рыбовод» с 24.06. 2004, №001-1062» А «до этой стороны зарегистрирован в качестве государственного унитарного предприятия»рыба Таджикистан " Министерства сельского хозяйства Республики Таджикистан в Министерстве юстиции Республики Таджикистан.

На основании Постановления Правительства Республики Таджикистан за №123 от 3 марта 2001 года «О мерах по восстановлению рыбоводческой отрасли в Республике Таджикистан» о выделении пахотных земель для рыбоводства рыбоводческим хозяйствам ОАО «рыбоводство хушотзот»города Пенджикент-100 га, ОАО «рыбоводство хушот»района А.ОАО «Красный цветок»района Дружбы-400 га, государственное рыбоводческое хозяйство «Чубек»-выделено. 

В соответствии с графиком работы ГУП «Моҳии Тоҷикистон» с 6 рабочими задачами, утвержденными министром сельского хозяйства в 2020 году, действующим по состоянию на 01.01.2021 -5 сотрудников.

Государственное унитарное предприятие «Моҳии Тоҷикистон» за качество экологически чистой продукции было удостоено премии платиновая Звезда Международной избирательной комиссией в Мадриде (Испания) в 2002, 2003 годах. Предприятие было удостоено международной премии «Золотой стран Европы» за технологию производства в 2003 году. » Рыба Таджикистана «также удостоена награды» Лидер отрасли " Crystal Earthmaker за успешную адаптацию к быстро меняющимся условиям рыночной экономики.